1、IPP的3D渲染和測量功能模塊Image-Pro Plus 3D –Media Cybernetics公司

　　Media Cybernetics公司的IPP適用于醫學、科學研究，工業和其他領域，從圖像采集、處理、分析，到報告、存檔、輸出，IPP都能輕松完成。該軟件可完成包括動態圖像(Time Laps),多層光切(Zstack)，或多通道熒光圖像(Multi-Channel)的獲取和分析等復雜要求。

　　該軟件包括以下專業應用模塊，這些專業應用模塊都是按照實際的工作模式，照典型的實驗協議設計的：

　　材料分析模塊(Materials-Pro)：為材料科學或工業領域的研究和技術人員設計，應用于質量控制和產品開發的專業產品;

　　電動顯微鏡控制模塊(Scope-Pro)：為需要對電動顯微鏡進行控制和要求高自動化的用戶設計。

　　高級熒光圖像采集模塊(AFA)：通過控制電動熒光顯微鏡及電動樣品臺，可管理和控制以下圖像采集模式的任意組合：時間，熒光通道，多焦面，樣品位置。

　　三維反卷積模塊和三維重建模塊(Sharp-Stack and 3D Constructor)：最新的三維重建模塊將采集于電動或共焦顯微鏡的序列光切圖像中所隱藏或難于理解的信息提取和表達出來。

　　2、Imaris軟件—瑞士Bitplane公司

　　Bitplane 的Imaris 系列模塊是生命科學領域中的顯微圖像分析中，多維圖像處理和分析的主導軟件，軟件包功能齊全、分類細致，包括Imaris(基礎模塊)、Imaris Measurementpro(測量軟件)、ImarisTrack(三維運動尋跡模塊)、ImarisColoc(共定位分析軟件)、FilamentTracer(檢測，尋蹤和分析絲狀體模塊)、AutoDeblur(自動解模糊，自動反卷積軟件)、AutoAligner(自動對準軟件)。

　　3、Volocity軟件—Perkinelmer公司

　　Volocity®是一組高度集成化的軟件產品，能完成多通道熒光標記的細胞圖像的三維、四維立體觀測、定量分析和高品質圖像或動畫電影制作的工作。該軟件包括Volocity Acquisition(細胞圖像觀測采集平臺)、Volocity Visualization(細胞圖像三維立體操作平臺)、Volocity Quantitation(細胞圖像定量分析平臺)和Volocity Restoration(細胞圖像消霧去卷積復原平臺)。該軟件家族中的每一個產品既可以單獨的使用，亦可以聯合的運用，以滿足各種基于細胞圖像分析定量的研究需要，如三維立體的觀測和展示操作、寬場熒光圖像的消霧去卷積復原、細胞內目標觀測物的定量測定、動態示蹤、量化參數列表和運動趨勢/模式作圖和視頻電影制作等。該軟件產品可在Mac和Windows®操作系統上運行。

　　Volocity軟件產品兼容識別各種激光共聚焦和寬場熒光顯微鏡獲取的圖像。使用者只需將原始的細胞圖像“拖-放”到Volocity軟件操作平臺的圖像文件庫中，就能方便快速的分析觀察和處理3D和4D的圖像數據。該軟件的獨特設計曾榮獲國際大獎，其直觀的用戶界面，使得軟件使用者能方便快速的掌握各種工具的操作使用，并能立即獲得分析的結果。