配制培養(yǎng)基首先要明確培養(yǎng)目的，要培養(yǎng)什么微生物?是為了得到菌體還是代謝產(chǎn)物?是用于實(shí)驗(yàn)室還是發(fā)酵生產(chǎn)?根據(jù)不同的目的，配制不同的培養(yǎng)基。

　　培養(yǎng)細(xì)菌、放線菌、酵母菌、霉菌所需要的培養(yǎng)基是不同的。在實(shí)驗(yàn)室中常用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基培養(yǎng)異養(yǎng)細(xì)菌，培養(yǎng)特殊類型的微生物還需特殊的培養(yǎng)基。

　　自養(yǎng)型微生物有較強(qiáng)的合成能力，所以培養(yǎng)自養(yǎng)型微生物培養(yǎng)基完全由簡單的無機(jī)物組成。異養(yǎng)型微生物的合成能力較弱，所以培養(yǎng)基中至少要有一種有機(jī)物，通常是葡萄糖。有的異養(yǎng)型微生物需要多種生長因子，因此常采用天然有機(jī)物為其提供所需的生長因子。

　　如果為了獲得菌體或作種子培養(yǎng)基用，一般來說，培養(yǎng)基的營養(yǎng)成分宜豐富些，特別是氮源含量應(yīng)高些，以利于微生物的生長與繁殖。如果為了獲得代謝產(chǎn)物或用作發(fā)酵培養(yǎng)基，則所含氮源宜低些，以使微生物生長不致過旺而有利于代謝產(chǎn)物的積累。在有些代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)中還要加入作為它們組成部分的元素或前體物質(zhì)，如生產(chǎn)維生素B12時要加入鈷鹽，在金霉素生產(chǎn)中要加入氯化物，生產(chǎn)芐青霉素時要加入其前體物質(zhì)苯乙酸。

　　營養(yǎng)協(xié)調(diào)

　　培養(yǎng)基應(yīng)含有維持微生物最適生長所必須的一切營養(yǎng)物質(zhì)。但更為重要的是，營養(yǎng)物質(zhì)的濃度與配比要合適。

　　營養(yǎng)物質(zhì)濃度過低不能滿足其生長的需要;過高又抑制其生長。例如，適量的蔗糖是異養(yǎng)型微生物的良好碳源和能源，但高濃度的蔗糖則抑制微生物生長。金屬離子是微生物生長所不可缺少的礦質(zhì)養(yǎng)分，但濃度過大，特別是重金屬離子，反而抑制其生長，甚至產(chǎn)生殺菌作用。

　　各營養(yǎng)物質(zhì)之間的配比，特別是碳氮比(C/N比)直接影響微生物的生長繁殖和代謝產(chǎn)物的積累。C/N比一般指培養(yǎng)基中元素碳和元素氮的比值，有時也指培養(yǎng)基中還原糖與粗蛋白的含量之比。不同的微生物要求不同的C/N比。如細(xì)菌和酵母菌培養(yǎng)基中的C/N比約為5/1，霉菌培養(yǎng)基中的C/N比約為10/l。在微生物發(fā)酵生產(chǎn)中，C/N比直接影響發(fā)酵產(chǎn)量，如谷氨酸發(fā)酵中需要較多的氮作為合成谷氨酸的氮源，若培養(yǎng)基C/N比為4/1，則菌體大量繁殖，谷氨酸積累少;若培養(yǎng)基C/N比為3/1，則菌體繁殖受抑制，谷氨酸產(chǎn)量增加。

　　此外，還須注意培養(yǎng)基中無機(jī)鹽的量以及它們之間的平衡;生長因子的添加也要注意比例適當(dāng)，以保證微生物對各生長因子的平衡吸收。