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研究人員開發出對水、土壤中的病原體檢測的快速方法
[2015/10/10]
以色列本-古里安大學和美國麻省理工學院的研究人員開發出一種高敏感度,節約成本的技術,只需在24小時之內,就能快速完成空氣、土壤、水和農產品中的細菌性病原體檢測。
根據這項研究的領導者,正在本-古里安大學扎克伯格水研究所攻讀博士學位的以斯拉奧洛夫斯基博士介紹,“現場樣本中快速可靠的病原體檢測對于公共衛生、安全和環境監測是至關重要的。目前在食品、水或臨床應用上使用的方法需要依賴實驗室以及花費大量的時間培養技術,比如在乳品業、廢水和徑流處理這樣的活動中,需要在環境樣本中實時監測病原體。
這項發表在《水、空氣&土壤污染》期刊網絡版上的研究,定義了一個準確的、價格低廉的、高通量的以及快速的替代方法來檢測不同環境樣本中的病原。“這是首次在種類廣泛的環境樣本類型中,全面評估病原體濃度的研究,通過標準(或傳統)方法,利用完整的并行測試,實現多病原檢測。
“我們能夠在24小時內準確地確定土壤樣品中的沙門氏菌,而傳統的方法需要四到五天,而且需要分類,”以斯拉奧洛夫斯基博士說。“我們還成功地確定了一種致命的感染,銅綠假單胞菌,存在于氣溶膠中,是國內污水處理系統中的產生的。結果表明,我們開發的技術提供了一種廣泛的方法,在具有挑戰性的環境樣品中的快速,高效,可靠地檢測出相對低濃度的致病微生物。
為了評估這項技術,各種類型的環境樣本,包括氣溶膠,各種土壤類型,廢水和蔬菜表面(番茄),被同時侵入了沙門氏菌或銅綠假單胞菌。研究人員選擇了這些病原是因為他們是主要的致病病原,在環境中有著較高的生存潛能,而且在濃度低的時候很難被準確地檢測出來。
“當這個方法應用于沒有侵入病原的現場樣本時,我們的方法顯著優于標準方法,能夠在收到樣本一天之內檢測出病原,” 以斯拉奧洛夫斯基博士說。“由于這個集中而且經濟的檢測程序告訴我們在一天之內重點檢測哪里,因此我們不需要花費幾天時間來檢測數以百計的樣本和子樣本。”
這個快速檢測方法同時使用了兩種技術,一個是用于微生物檢測的進化的“MPN-type enrichment”技術,再加上廣泛用于分子生物學用于實時監測DNA擴增的“qPCR”技術。
“我們大大縮短了之前的方案,也不再使用任何名牌昂貴的試劑對DNA進行提純和凈化,也不用增加工作流程,從原始樣品很容易地進行到qPCR實驗,” 以斯拉奧洛夫斯基博士說。
土壤、水和蔬菜樣本的檢測是高度敏感的(低至每一個細胞的測試),研究人員認為需要額外的步驟來進一步提高檢測水平,使得這項技術能夠反映出氣溶膠中的低病原濃度(特別是低濃度感染劑量)。
研究人員推薦今后用這種方法來檢測其他病原,如軍團菌,金黃色葡萄球菌和空腸彎曲桿菌,其中第二個病菌是食源性疾病的最常見原因。