活體生物檢測：不需要農藥殘留速測儀，無須前處理，但要求指示生物的精準性，測定范圍廣對各種毒物都可以。不能準確測定農藥品種，而且極可能出現假陽性或假陰性的情況，只能估算，不能精確定量分析，受很多因素影響最重要的就是難以找到與該產品同時種植的未施農藥產品做對照。

　　酶抑制法：檢測適用于現場的定性和半定量測定，該方法檢測時，蔬菜中物質（水份、碳水化合物、蛋白質、脂）等不會對農藥殘留物的檢測造成影響，節省了大量預處理時間，不必進行復雜的分離去雜工作，農藥殘留速測儀不需要使用或使用的農藥殘留速測儀相對簡單，無須大型設備和專業人員，成本較低，酶片保存時間長。不過使用此方法只能測定殺蟲劑（有機磷和氨基甲酸酯類），而且檢測的靈敏度和檢測使用的酶、顯色反應時間和檢測時的溫度有很大關系，經酶法檢測出陽性，后續工作還需用標準農藥殘留速測儀檢驗方法進一步檢測，只有這樣才能鑒定殘留農藥品種及準確殘留量。因此要想得到準確檢測結果耗時、耗力。免疫法檢測適用于現場檢測，因其特異性強，靈敏度高，檢測農殘快速簡便，又具有精確的定量定性功能，但抗體制備難度大，因為農藥種類多，在不能肯定樣本中的農藥殘留種類時一定的盲目性，檢測時易出現假陰，假陽性現象，加之目前我國市場上酶聯免疫法成品試劑盒依賴從國外進口。因上述種種原因酶聯免疫法受到較大限制的使用。

　　化學法：強催化作用的離子催化劑適合于現場檢測，使用此方法檢測速度快、使用成本低、操作簡便、針對性強。因其采用化學反應，避免了生化方法---酶法（酶的制備、保存以及反應需比較嚴格的條件）使用繁瑣的缺點，也達到了一定的靈敏度。但此方法檢測范圍狹窄主要定性的針對有機磷農藥（甲胺磷、對硫磷等較高毒性）殘留的檢測。

　　目前高科技高新分析技術被引入到農藥殘留檢測之中，歐盟等國家采用聯用技術，如：氣相色譜與質譜聯用以及氣相、液相色譜與多級質譜聯用等多種聯用方法，所謂聯用技術就是定性分析待測樣品中的殘留農藥的種類，待測定種類后再利用氣相色譜對殘留農藥的含量進行定量分析。使用此方法不但節省了大量的時間和操作步驟，而且可以一次排除樣品中多種類型農藥，使檢測結果更為精確。